Prof. dr. Krunoslav Antoliš je član številnih programskih in organizacijskih mednarodnih znanstvenih timov na področju kibernetske varnosti in kriminalitete v različnih funkcijah, med drugim kot predsednik organizacijskega ter programskega odbora. Sodeloval je na številnih znanstvenih projektih Ministrstva znanosti Republike Hrvaške, od katerih posebej izpostavljamo vodenje znanstvenega projekta Nove varnostne grožnje in kritična državna infrastruktura, ter več projektov financiranih v okviru konzorcija vojaških akademij in varnostnih inštitutov. Vodil je več kot petnajst strokovnih projektov na ravni Ministrstva za obrambo in notranje zadeve Republike Hrvaške, Ministrstva za notranje zadeve Republike Hrvaške kot je vodenje projekta Nacionalna strategija za preprečevanje in zatiranje terorizma Republike Hrvaške.